Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SelpQ01102 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SelpQ01102 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SelpQ01102 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SelpQ01102 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SelpQ01102 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SelpQ01102 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SelpQ01102 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SelpQ01102 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SelpQ01102 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SelpQ01102 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SelpQ01102 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SelpQ01102 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SelpQ01102 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SelpQ01102 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SelpQ01102 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SelpQ01102 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SelpQ01102 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SelpQ01102 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SelpQ01102 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SelpQ01102 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SelpQ01102 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SelpQ01102 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SelpQ01102 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SelpQ01102 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SelpQ01102 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SelpQ01102 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SelpQ01102 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SelpQ01102 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SelpQ01102 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SelpQ01102 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SelpQ01102 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SelpQ01102 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SelpQ01102 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SelpQ01102 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SelpQ01102 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SelpQ01102 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SelpQ01102 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SelpQ01102 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SelpQ01102 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SelpQ01102 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SelpQ01102 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SelpQ01102 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SelpQ01102 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SelpQ01102 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SelpQ01102 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SelpQ01102 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SelpQ01102 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SelpQ01102 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SelpQ01102 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SelpQ01102 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SelpQ01102 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SelpQ01102 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SelpQ01102 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SelpQ01102 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SelpQ01102 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SelpQ01102 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SelpQ01102 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SelpQ01102 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SelpQ01102 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SelpQ01102 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SelpQ01102 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SelpQ01102 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SelpQ01102 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SelpQ01102 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SelpQ01102 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SelpQ01102 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SelpQ01102 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SelpQ01102 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SelpQ01102 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SelpQ01102 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SelpQ01102 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SelpQ01102 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SelpQ01102 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SelpQ01102 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SelpQ01102 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SelpQ01102 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SelpQ01102 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SelpQ01102 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SelpQ01102 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SelpQ01102 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SelpQ01102 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SelpQ01102 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SelpQ01102 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SelpQ01102 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SelpQ01102 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SelpQ01102 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SelpQ01102 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SelpQ01102 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SelpQ01102 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SelpQ01102 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SelpQ01102 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SelpQ01102 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SelpQ01102 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SelpQ01102 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SelpQ01102 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SelpQ01102 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SelpQ01102 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SelpQ01102 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SelpQ01102 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms