Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Grin2cQ01098 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grin2cQ01098 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms