Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Grin2bQ01097 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Grin2bQ01097 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Grin2bQ01097 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Grin2bQ01097 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Grin2bQ01097 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Grin2bQ01097 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Grin2bQ01097 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Grin2bQ01097 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Grin2bQ01097 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Grin2bQ01097 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Grin2bQ01097 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Grin2bQ01097 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Grin2bQ01097 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Grin2bQ01097 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Grin2bQ01097 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Grin2bQ01097 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Grin2bQ01097 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Grin2bQ01097 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Grin2bQ01097 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Grin2bQ01097 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Grin2bQ01097 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Grin2bQ01097 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Grin2bQ01097 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Grin2bQ01097 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Grin2bQ01097 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Grin2bQ01097 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Grin2bQ01097 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Grin2bQ01097 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Grin2bQ01097 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Grin2bQ01097 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Grin2bQ01097 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Grin2bQ01097 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Grin2bQ01097 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Grin2bQ01097 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Grin2bQ01097 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Grin2bQ01097 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Grin2bQ01097 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Grin2bQ01097 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Grin2bQ01097 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Grin2bQ01097 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Grin2bQ01097 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Grin2bQ01097 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Grin2bQ01097 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Grin2bQ01097 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Grin2bQ01097 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Grin2bQ01097 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Grin2bQ01097 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Grin2bQ01097 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Grin2bQ01097 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Grin2bQ01097 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Grin2bQ01097 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Grin2bQ01097 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Grin2bQ01097 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Grin2bQ01097 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Grin2bQ01097 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Grin2bQ01097 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Grin2bQ01097 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Grin2bQ01097 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Grin2bQ01097 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Grin2bQ01097 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Grin2bQ01097 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Grin2bQ01097 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Grin2bQ01097 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Grin2bQ01097 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Grin2bQ01097 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Grin2bQ01097 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Grin2bQ01097 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Grin2bQ01097 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Grin2bQ01097 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Grin2bQ01097 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Grin2bQ01097 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Grin2bQ01097 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Grin2bQ01097 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Grin2bQ01097 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Grin2bQ01097 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Grin2bQ01097 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Grin2bQ01097 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Grin2bQ01097 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Grin2bQ01097 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Grin2bQ01097 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Grin2bQ01097 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Grin2bQ01097 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Grin2bQ01097 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Grin2bQ01097 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Grin2bQ01097 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Grin2bQ01097 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Grin2bQ01097 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Grin2bQ01097 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Grin2bQ01097 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Grin2bQ01097 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Grin2bQ01097 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Grin2bQ01097 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Grin2bQ01097 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Grin2bQ01097 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Grin2bQ01097 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Grin2bQ01097 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Grin2bQ01097 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Grin2bQ01097 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Grin2bQ01097 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms