Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjb2Q00977 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms