Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Serpina1cQ00896 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Serpina1cQ00896 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Serpina1cQ00896 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Serpina1cQ00896 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Serpina1cQ00896 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms