Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VegfaQ00731 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms