Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
F8a1Q00558 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms