Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gabpb1Q00420 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gabpb1Q00420 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gabpb1Q00420 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gabpb1Q00420 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gabpb1Q00420 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gabpb1Q00420 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gabpb1Q00420 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gabpb1Q00420 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gabpb1Q00420 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gabpb1Q00420 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gabpb1Q00420 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gabpb1Q00420 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gabpb1Q00420 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gabpb1Q00420 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gabpb1Q00420 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gabpb1Q00420 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gabpb1Q00420 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gabpb1Q00420 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gabpb1Q00420 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gabpb1Q00420 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gabpb1Q00420 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gabpb1Q00420 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gabpb1Q00420 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gabpb1Q00420 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gabpb1Q00420 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gabpb1Q00420 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gabpb1Q00420 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gabpb1Q00420 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gabpb1Q00420 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gabpb1Q00420 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gabpb1Q00420 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gabpb1Q00420 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gabpb1Q00420 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gabpb1Q00420 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms