Protein–RNA interactions for Protein: Q00286

Pou1f1, Pituitary-specific positive transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou1f1Q00286 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou1f1Q00286 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou1f1Q00286 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou1f1Q00286 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou1f1Q00286 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou1f1Q00286 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou1f1Q00286 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou1f1Q00286 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou1f1Q00286 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou1f1Q00286 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou1f1Q00286 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou1f1Q00286 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou1f1Q00286 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou1f1Q00286 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou1f1Q00286 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou1f1Q00286 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou1f1Q00286 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou1f1Q00286 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou1f1Q00286 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou1f1Q00286 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou1f1Q00286 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou1f1Q00286 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou1f1Q00286 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou1f1Q00286 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou1f1Q00286 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou1f1Q00286 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou1f1Q00286 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou1f1Q00286 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou1f1Q00286 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou1f1Q00286 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou1f1Q00286 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou1f1Q00286 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou1f1Q00286 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou1f1Q00286 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou1f1Q00286 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou1f1Q00286 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou1f1Q00286 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou1f1Q00286 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou1f1Q00286 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pou1f1Q00286 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pou1f1Q00286 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pou1f1Q00286 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pou1f1Q00286 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pou1f1Q00286 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pou1f1Q00286 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pou1f1Q00286 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou1f1Q00286 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou1f1Q00286 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou1f1Q00286 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou1f1Q00286 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou1f1Q00286 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou1f1Q00286 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou1f1Q00286 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou1f1Q00286 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou1f1Q00286 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou1f1Q00286 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou1f1Q00286 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou1f1Q00286 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou1f1Q00286 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou1f1Q00286 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou1f1Q00286 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou1f1Q00286 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou1f1Q00286 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou1f1Q00286 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou1f1Q00286 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou1f1Q00286 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou1f1Q00286 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou1f1Q00286 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou1f1Q00286 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou1f1Q00286 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou1f1Q00286 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou1f1Q00286 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou1f1Q00286 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou1f1Q00286 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou1f1Q00286 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou1f1Q00286 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou1f1Q00286 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou1f1Q00286 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou1f1Q00286 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou1f1Q00286 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou1f1Q00286 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou1f1Q00286 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou1f1Q00286 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou1f1Q00286 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou1f1Q00286 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou1f1Q00286 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou1f1Q00286 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou1f1Q00286 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou1f1Q00286 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou1f1Q00286 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou1f1Q00286 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou1f1Q00286 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou1f1Q00286 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou1f1Q00286 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou1f1Q00286 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou1f1Q00286 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou1f1Q00286 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou1f1Q00286 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou1f1Q00286 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou1f1Q00286 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms