Protein–RNA interactions for Protein: P98191

Cds1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds1P98191 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cds1P98191 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cds1P98191 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cds1P98191 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cds1P98191 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cds1P98191 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cds1P98191 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cds1P98191 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cds1P98191 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cds1P98191 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cds1P98191 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cds1P98191 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cds1P98191 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms