Protein–RNA interactions for Protein: P97812

Ihh, Indian hedgehog protein, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IhhP97812 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IhhP97812 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IhhP97812 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IhhP97812 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IhhP97812 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IhhP97812 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IhhP97812 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IhhP97812 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IhhP97812 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IhhP97812 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IhhP97812 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IhhP97812 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IhhP97812 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IhhP97812 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IhhP97812 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IhhP97812 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IhhP97812 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IhhP97812 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IhhP97812 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IhhP97812 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IhhP97812 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IhhP97812 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IhhP97812 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IhhP97812 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IhhP97812 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IhhP97812 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IhhP97812 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
IhhP97812 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IhhP97812 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
IhhP97812 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IhhP97812 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IhhP97812 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IhhP97812 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IhhP97812 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IhhP97812 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IhhP97812 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IhhP97812 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IhhP97812 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IhhP97812 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IhhP97812 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IhhP97812 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IhhP97812 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IhhP97812 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IhhP97812 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
IhhP97812 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IhhP97812 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IhhP97812 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IhhP97812 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IhhP97812 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IhhP97812 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IhhP97812 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IhhP97812 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IhhP97812 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IhhP97812 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IhhP97812 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IhhP97812 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IhhP97812 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
IhhP97812 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IhhP97812 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
IhhP97812 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IhhP97812 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
IhhP97812 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IhhP97812 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
IhhP97812 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IhhP97812 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IhhP97812 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IhhP97812 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IhhP97812 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IhhP97812 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IhhP97812 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IhhP97812 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
IhhP97812 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
IhhP97812 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IhhP97812 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IhhP97812 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IhhP97812 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IhhP97812 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IhhP97812 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IhhP97812 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
IhhP97812 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
IhhP97812 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IhhP97812 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IhhP97812 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
IhhP97812 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IhhP97812 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IhhP97812 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IhhP97812 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IhhP97812 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IhhP97812 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IhhP97812 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IhhP97812 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IhhP97812 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IhhP97812 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IhhP97812 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IhhP97812 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IhhP97812 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IhhP97812 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IhhP97812 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IhhP97812 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IhhP97812 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms