Protein–RNA interactions for Protein: P97801

Smn1, Survival motor neuron protein, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smn1P97801 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smn1P97801 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smn1P97801 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smn1P97801 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smn1P97801 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smn1P97801 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smn1P97801 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smn1P97801 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smn1P97801 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Smn1P97801 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Smn1P97801 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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