Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AlkP97793 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AlkP97793 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AlkP97793 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AlkP97793 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AlkP97793 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AlkP97793 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AlkP97793 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AlkP97793 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AlkP97793 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AlkP97793 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AlkP97793 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AlkP97793 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AlkP97793 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
AlkP97793 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AlkP97793 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AlkP97793 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AlkP97793 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
AlkP97793 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AlkP97793 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AlkP97793 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AlkP97793 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
AlkP97793 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
AlkP97793 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
AlkP97793 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AlkP97793 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AlkP97793 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AlkP97793 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AlkP97793 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AlkP97793 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AlkP97793 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AlkP97793 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
AlkP97793 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AlkP97793 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AlkP97793 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AlkP97793 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AlkP97793 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AlkP97793 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AlkP97793 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AlkP97793 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AlkP97793 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
AlkP97793 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
AlkP97793 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AlkP97793 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
AlkP97793 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
AlkP97793 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AlkP97793 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AlkP97793 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AlkP97793 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AlkP97793 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AlkP97793 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
AlkP97793 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AlkP97793 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AlkP97793 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AlkP97793 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AlkP97793 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AlkP97793 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AlkP97793 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AlkP97793 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AlkP97793 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AlkP97793 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AlkP97793 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AlkP97793 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AlkP97793 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AlkP97793 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AlkP97793 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AlkP97793 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AlkP97793 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AlkP97793 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AlkP97793 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
AlkP97793 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AlkP97793 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AlkP97793 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AlkP97793 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AlkP97793 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AlkP97793 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AlkP97793 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AlkP97793 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AlkP97793 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AlkP97793 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AlkP97793 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AlkP97793 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
AlkP97793 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AlkP97793 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AlkP97793 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AlkP97793 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AlkP97793 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
AlkP97793 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AlkP97793 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AlkP97793 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AlkP97793 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AlkP97793 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AlkP97793 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AlkP97793 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
AlkP97793 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
AlkP97793 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
AlkP97793 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
AlkP97793 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
AlkP97793 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
AlkP97793 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms