Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smarcc1P97496 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Smarcc1P97496 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms