Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nbr1P97432 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nbr1P97432 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms