Protein–RNA interactions for Protein: P97368

Meis3, Homeobox protein Meis3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis3P97368 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Meis3P97368 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Meis3P97368 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Meis3P97368 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Meis3P97368 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Meis3P97368 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Meis3P97368 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Meis3P97368 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Meis3P97368 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Meis3P97368 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Meis3P97368 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Meis3P97368 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Meis3P97368 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Meis3P97368 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Meis3P97368 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Meis3P97368 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Meis3P97368 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Meis3P97368 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Meis3P97368 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Meis3P97368 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Meis3P97368 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Meis3P97368 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Meis3P97368 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Meis3P97368 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Meis3P97368 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Meis3P97368 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Meis3P97368 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Meis3P97368 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Meis3P97368 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Meis3P97368 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Meis3P97368 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Meis3P97368 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Meis3P97368 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Meis3P97368 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Meis3P97368 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms