Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SmsP97355 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SmsP97355 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SmsP97355 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SmsP97355 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SmsP97355 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SmsP97355 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SmsP97355 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SmsP97355 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SmsP97355 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SmsP97355 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SmsP97355 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SmsP97355 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SmsP97355 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SmsP97355 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SmsP97355 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SmsP97355 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SmsP97355 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SmsP97355 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SmsP97355 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SmsP97355 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SmsP97355 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SmsP97355 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SmsP97355 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SmsP97355 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SmsP97355 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SmsP97355 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SmsP97355 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SmsP97355 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SmsP97355 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SmsP97355 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SmsP97355 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SmsP97355 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SmsP97355 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SmsP97355 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SmsP97355 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SmsP97355 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SmsP97355 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SmsP97355 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SmsP97355 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SmsP97355 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SmsP97355 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SmsP97355 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SmsP97355 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SmsP97355 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SmsP97355 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SmsP97355 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SmsP97355 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SmsP97355 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SmsP97355 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SmsP97355 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SmsP97355 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SmsP97355 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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SmsP97355 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SmsP97355 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SmsP97355 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SmsP97355 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SmsP97355 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SmsP97355 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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SmsP97355 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SmsP97355 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SmsP97355 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SmsP97355 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SmsP97355 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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SmsP97355 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SmsP97355 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SmsP97355 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SmsP97355 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SmsP97355 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SmsP97355 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
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