Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RhodP97348 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RhodP97348 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RhodP97348 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RhodP97348 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RhodP97348 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RhodP97348 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RhodP97348 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RhodP97348 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RhodP97348 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RhodP97348 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RhodP97348 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RhodP97348 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RhodP97348 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RhodP97348 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RhodP97348 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RhodP97348 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RhodP97348 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RhodP97348 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RhodP97348 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RhodP97348 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
RhodP97348 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RhodP97348 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RhodP97348 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RhodP97348 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RhodP97348 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RhodP97348 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RhodP97348 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RhodP97348 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RhodP97348 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RhodP97348 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RhodP97348 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RhodP97348 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RhodP97348 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RhodP97348 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RhodP97348 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
RhodP97348 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RhodP97348 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RhodP97348 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RhodP97348 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RhodP97348 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RhodP97348 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RhodP97348 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RhodP97348 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RhodP97348 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RhodP97348 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RhodP97348 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RhodP97348 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RhodP97348 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RhodP97348 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RhodP97348 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RhodP97348 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RhodP97348 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RhodP97348 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RhodP97348 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RhodP97348 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RhodP97348 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RhodP97348 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RhodP97348 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RhodP97348 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RhodP97348 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RhodP97348 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RhodP97348 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RhodP97348 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RhodP97348 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RhodP97348 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RhodP97348 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RhodP97348 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RhodP97348 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RhodP97348 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RhodP97348 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RhodP97348 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RhodP97348 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RhodP97348 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RhodP97348 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RhodP97348 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RhodP97348 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RhodP97348 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RhodP97348 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RhodP97348 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RhodP97348 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RhodP97348 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RhodP97348 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RhodP97348 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RhodP97348 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RhodP97348 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RhodP97348 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RhodP97348 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RhodP97348 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RhodP97348 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RhodP97348 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RhodP97348 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RhodP97348 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.03■□□□□ -0
RhodP97348 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RhodP97348 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RhodP97348 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RhodP97348 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RhodP97348 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RhodP97348 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RhodP97348 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms