Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arf1P84078 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arf1P84078 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arf1P84078 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arf1P84078 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arf1P84078 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arf1P84078 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arf1P84078 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Arf1P84078 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arf1P84078 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arf1P84078 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms