Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otx2P80206 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otx2P80206 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otx2P80206 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otx2P80206 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otx2P80206 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otx2P80206 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otx2P80206 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otx2P80206 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otx2P80206 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otx2P80206 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otx2P80206 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms