Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smad1P70340 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smad1P70340 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smad1P70340 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smad1P70340 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smad1P70340 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smad1P70340 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Smad1P70340 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smad1P70340 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smad1P70340 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms