Protein–RNA interactions for Protein: P70321

Hoxb13, Homeobox protein Hox-B13, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb13P70321 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb13P70321 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb13P70321 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb13P70321 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb13P70321 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb13P70321 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb13P70321 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb13P70321 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb13P70321 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb13P70321 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb13P70321 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb13P70321 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb13P70321 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb13P70321 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxb13P70321 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxb13P70321 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxb13P70321 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxb13P70321 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxb13P70321 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxb13P70321 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxb13P70321 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxb13P70321 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxb13P70321 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxb13P70321 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxb13P70321 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxb13P70321 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxb13P70321 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxb13P70321 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxb13P70321 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxb13P70321 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxb13P70321 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxb13P70321 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxb13P70321 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb13P70321 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb13P70321 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb13P70321 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb13P70321 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb13P70321 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb13P70321 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb13P70321 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb13P70321 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb13P70321 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb13P70321 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb13P70321 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb13P70321 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb13P70321 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb13P70321 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb13P70321 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxb13P70321 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxb13P70321 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxb13P70321 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxb13P70321 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxb13P70321 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxb13P70321 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxb13P70321 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxb13P70321 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxb13P70321 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxb13P70321 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb13P70321 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb13P70321 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb13P70321 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb13P70321 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb13P70321 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb13P70321 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb13P70321 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb13P70321 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb13P70321 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb13P70321 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb13P70321 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb13P70321 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb13P70321 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb13P70321 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb13P70321 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb13P70321 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb13P70321 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb13P70321 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb13P70321 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb13P70321 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb13P70321 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb13P70321 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb13P70321 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb13P70321 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxb13P70321 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxb13P70321 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxb13P70321 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxb13P70321 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxb13P70321 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxb13P70321 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxb13P70321 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxb13P70321 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxb13P70321 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxb13P70321 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxb13P70321 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxb13P70321 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxb13P70321 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxb13P70321 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxb13P70321 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxb13P70321 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxb13P70321 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxb13P70321 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms