Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cux2P70298 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cux2P70298 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cux2P70298 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cux2P70298 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cux2P70298 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cux2P70298 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cux2P70298 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cux2P70298 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cux2P70298 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Cux2P70298 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cux2P70298 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cux2P70298 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cux2P70298 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Cux2P70298 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cux2P70298 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cux2P70298 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cux2P70298 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cux2P70298 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Cux2P70298 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cux2P70298 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cux2P70298 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cux2P70298 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cux2P70298 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cux2P70298 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cux2P70298 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cux2P70298 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cux2P70298 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Cux2P70298 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cux2P70298 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cux2P70298 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cux2P70298 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cux2P70298 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cux2P70298 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cux2P70298 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cux2P70298 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cux2P70298 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cux2P70298 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cux2P70298 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cux2P70298 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cux2P70298 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cux2P70298 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cux2P70298 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cux2P70298 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cux2P70298 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cux2P70298 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cux2P70298 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cux2P70298 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cux2P70298 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cux2P70298 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cux2P70298 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cux2P70298 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cux2P70298 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cux2P70298 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Cux2P70298 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Cux2P70298 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Cux2P70298 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Cux2P70298 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Cux2P70298 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Cux2P70298 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cux2P70298 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cux2P70298 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cux2P70298 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cux2P70298 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cux2P70298 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cux2P70298 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cux2P70298 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cux2P70298 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cux2P70298 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cux2P70298 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cux2P70298 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cux2P70298 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Cux2P70298 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cux2P70298 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cux2P70298 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cux2P70298 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cux2P70298 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cux2P70298 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cux2P70298 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Cux2P70298 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cux2P70298 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cux2P70298 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cux2P70298 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cux2P70298 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cux2P70298 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cux2P70298 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cux2P70298 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cux2P70298 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cux2P70298 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cux2P70298 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cux2P70298 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cux2P70298 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cux2P70298 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cux2P70298 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cux2P70298 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cux2P70298 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cux2P70298 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cux2P70298 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cux2P70298 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Cux2P70298 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms