Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad54lP70270 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms