Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chl1P70232 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Chl1P70232 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chl1P70232 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chl1P70232 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chl1P70232 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chl1P70232 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chl1P70232 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chl1P70232 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chl1P70232 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chl1P70232 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chl1P70232 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Chl1P70232 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chl1P70232 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chl1P70232 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chl1P70232 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chl1P70232 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chl1P70232 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chl1P70232 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chl1P70232 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chl1P70232 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chl1P70232 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chl1P70232 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chl1P70232 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chl1P70232 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chl1P70232 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Chl1P70232 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chl1P70232 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chl1P70232 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chl1P70232 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chl1P70232 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Chl1P70232 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chl1P70232 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chl1P70232 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chl1P70232 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chl1P70232 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chl1P70232 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chl1P70232 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Chl1P70232 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Chl1P70232 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Chl1P70232 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Chl1P70232 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chl1P70232 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chl1P70232 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Chl1P70232 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Chl1P70232 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Chl1P70232 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chl1P70232 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Chl1P70232 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chl1P70232 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chl1P70232 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chl1P70232 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chl1P70232 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chl1P70232 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chl1P70232 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chl1P70232 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chl1P70232 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chl1P70232 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chl1P70232 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chl1P70232 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chl1P70232 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chl1P70232 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chl1P70232 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chl1P70232 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chl1P70232 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chl1P70232 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chl1P70232 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chl1P70232 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chl1P70232 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chl1P70232 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chl1P70232 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chl1P70232 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chl1P70232 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chl1P70232 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chl1P70232 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chl1P70232 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chl1P70232 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chl1P70232 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chl1P70232 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chl1P70232 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chl1P70232 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chl1P70232 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chl1P70232 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chl1P70232 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chl1P70232 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chl1P70232 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Chl1P70232 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chl1P70232 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chl1P70232 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chl1P70232 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chl1P70232 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chl1P70232 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chl1P70232 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chl1P70232 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chl1P70232 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chl1P70232 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chl1P70232 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chl1P70232 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chl1P70232 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chl1P70232 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms