Protein–RNA interactions for Protein: P70211

Dcc, Netrin receptor DCC, mousemouse

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DccP70211 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DccP70211 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DccP70211 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DccP70211 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DccP70211 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DccP70211 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DccP70211 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DccP70211 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DccP70211 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DccP70211 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DccP70211 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DccP70211 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DccP70211 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DccP70211 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DccP70211 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DccP70211 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DccP70211 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DccP70211 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DccP70211 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DccP70211 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DccP70211 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DccP70211 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DccP70211 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DccP70211 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DccP70211 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DccP70211 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DccP70211 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DccP70211 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DccP70211 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DccP70211 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DccP70211 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DccP70211 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DccP70211 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DccP70211 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DccP70211 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DccP70211 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DccP70211 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DccP70211 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DccP70211 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DccP70211 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DccP70211 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DccP70211 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DccP70211 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DccP70211 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DccP70211 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DccP70211 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DccP70211 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DccP70211 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DccP70211 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DccP70211 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DccP70211 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DccP70211 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DccP70211 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DccP70211 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DccP70211 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DccP70211 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DccP70211 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DccP70211 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DccP70211 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DccP70211 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DccP70211 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DccP70211 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DccP70211 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DccP70211 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DccP70211 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DccP70211 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DccP70211 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DccP70211 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DccP70211 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DccP70211 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DccP70211 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DccP70211 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DccP70211 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DccP70211 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DccP70211 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DccP70211 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DccP70211 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DccP70211 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DccP70211 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DccP70211 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DccP70211 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DccP70211 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DccP70211 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DccP70211 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DccP70211 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DccP70211 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DccP70211 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DccP70211 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DccP70211 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DccP70211 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DccP70211 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DccP70211 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DccP70211 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DccP70211 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DccP70211 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DccP70211 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DccP70211 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DccP70211 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DccP70211 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DccP70211 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms