Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Traf5P70191 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Traf5P70191 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Traf5P70191 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf5P70191 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf5P70191 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf5P70191 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf5P70191 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Traf5P70191 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Traf5P70191 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Traf5P70191 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Traf5P70191 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Traf5P70191 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms