Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SbdsP70122 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SbdsP70122 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SbdsP70122 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SbdsP70122 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SbdsP70122 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SbdsP70122 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SbdsP70122 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SbdsP70122 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SbdsP70122 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SbdsP70122 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms