Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Acta1P68134 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Acta1P68134 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Acta1P68134 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Acta1P68134 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acta1P68134 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acta1P68134 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Acta1P68134 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Acta1P68134 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms