Protein–RNA interactions for Protein: P62983

Rps27a, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27aP62983 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rps27aP62983 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps27aP62983 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps27aP62983 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps27aP62983 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps27aP62983 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps27aP62983 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps27aP62983 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rps27aP62983 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rps27aP62983 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps27aP62983 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rps27aP62983 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rps27aP62983 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps27aP62983 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps27aP62983 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps27aP62983 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps27aP62983 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps27aP62983 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps27aP62983 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps27aP62983 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rps27aP62983 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps27aP62983 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps27aP62983 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rps27aP62983 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps27aP62983 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps27aP62983 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rps27aP62983 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rps27aP62983 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rps27aP62983 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps27aP62983 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps27aP62983 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps27aP62983 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rps27aP62983 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps27aP62983 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps27aP62983 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps27aP62983 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rps27aP62983 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps27aP62983 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps27aP62983 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps27aP62983 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps27aP62983 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps27aP62983 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
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