Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rps29P62274 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rps29P62274 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rps29P62274 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rps29P62274 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Rps29P62274 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rps29P62274 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rps29P62274 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps29P62274 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps29P62274 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
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