Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms