Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga11P61622 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga11P61622 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga11P61622 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Itga11P61622 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Itga11P61622 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga11P61622 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga11P61622 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga11P61622 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga11P61622 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga11P61622 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms