Protein–RNA interactions for Protein: P61460

Depdc5, GATOR complex protein DEPDC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depdc5P61460 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Depdc5P61460 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Depdc5P61460 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Depdc5P61460 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Depdc5P61460 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Depdc5P61460 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Depdc5P61460 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Depdc5P61460 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Depdc5P61460 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Depdc5P61460 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Depdc5P61460 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Depdc5P61460 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Depdc5P61460 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Depdc5P61460 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Depdc5P61460 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Depdc5P61460 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Depdc5P61460 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Depdc5P61460 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Depdc5P61460 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Depdc5P61460 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Depdc5P61460 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Depdc5P61460 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Depdc5P61460 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Depdc5P61460 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Depdc5P61460 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Depdc5P61460 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Depdc5P61460 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Depdc5P61460 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Depdc5P61460 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Depdc5P61460 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Depdc5P61460 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Depdc5P61460 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Depdc5P61460 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Depdc5P61460 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Depdc5P61460 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Depdc5P61460 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Depdc5P61460 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Depdc5P61460 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Depdc5P61460 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Depdc5P61460 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Depdc5P61460 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Depdc5P61460 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Depdc5P61460 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Depdc5P61460 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Depdc5P61460 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Depdc5P61460 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Depdc5P61460 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Depdc5P61460 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Depdc5P61460 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Depdc5P61460 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Depdc5P61460 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Depdc5P61460 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Depdc5P61460 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Depdc5P61460 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Depdc5P61460 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Depdc5P61460 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Depdc5P61460 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Depdc5P61460 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Depdc5P61460 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Depdc5P61460 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Depdc5P61460 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Depdc5P61460 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Depdc5P61460 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Depdc5P61460 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Depdc5P61460 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Depdc5P61460 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Depdc5P61460 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Depdc5P61460 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Depdc5P61460 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Depdc5P61460 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Depdc5P61460 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Depdc5P61460 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Depdc5P61460 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Depdc5P61460 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Depdc5P61460 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Depdc5P61460 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Depdc5P61460 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Depdc5P61460 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Depdc5P61460 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Depdc5P61460 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Depdc5P61460 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Depdc5P61460 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Depdc5P61460 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Depdc5P61460 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Depdc5P61460 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Depdc5P61460 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Depdc5P61460 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Depdc5P61460 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Depdc5P61460 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Depdc5P61460 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Depdc5P61460 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Depdc5P61460 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Depdc5P61460 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Depdc5P61460 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Depdc5P61460 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Depdc5P61460 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Depdc5P61460 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Depdc5P61460 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Depdc5P61460 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Depdc5P61460 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms