Protein–RNA interactions for Protein: P61222

Abce1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abce1P61222 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abce1P61222 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abce1P61222 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Abce1P61222 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abce1P61222 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abce1P61222 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abce1P61222 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abce1P61222 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abce1P61222 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abce1P61222 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms