Protein–RNA interactions for Protein: P61092

Siah1a, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1A, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1aP61092 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Siah1aP61092 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Siah1aP61092 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Siah1aP61092 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Siah1aP61092 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Siah1aP61092 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Siah1aP61092 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Siah1aP61092 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Siah1aP61092 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Siah1aP61092 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Siah1aP61092 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Siah1aP61092 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Siah1aP61092 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Siah1aP61092 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Siah1aP61092 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Siah1aP61092 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Siah1aP61092 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Siah1aP61092 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Siah1aP61092 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Siah1aP61092 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Siah1aP61092 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Siah1aP61092 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Siah1aP61092 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Siah1aP61092 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Siah1aP61092 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Siah1aP61092 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Siah1aP61092 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Siah1aP61092 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Siah1aP61092 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Siah1aP61092 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Siah1aP61092 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms