Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms