Protein–RNA interactions for Protein: P60335

Pcbp1, Poly(rC)-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp1P60335 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcbp1P60335 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcbp1P60335 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcbp1P60335 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcbp1P60335 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcbp1P60335 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcbp1P60335 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcbp1P60335 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcbp1P60335 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcbp1P60335 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcbp1P60335 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcbp1P60335 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcbp1P60335 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcbp1P60335 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcbp1P60335 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcbp1P60335 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcbp1P60335 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcbp1P60335 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcbp1P60335 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcbp1P60335 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcbp1P60335 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcbp1P60335 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcbp1P60335 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcbp1P60335 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcbp1P60335 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcbp1P60335 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcbp1P60335 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcbp1P60335 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcbp1P60335 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcbp1P60335 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcbp1P60335 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcbp1P60335 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcbp1P60335 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcbp1P60335 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcbp1P60335 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcbp1P60335 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcbp1P60335 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcbp1P60335 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcbp1P60335 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcbp1P60335 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcbp1P60335 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcbp1P60335 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcbp1P60335 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcbp1P60335 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms