Protein–RNA interactions for Protein: P59326

Ythdf1, YTH domain-containing family protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdf1P59326 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ythdf1P59326 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ythdf1P59326 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ythdf1P59326 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ythdf1P59326 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ythdf1P59326 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ythdf1P59326 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ythdf1P59326 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ythdf1P59326 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ythdf1P59326 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ythdf1P59326 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ythdf1P59326 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ythdf1P59326 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ythdf1P59326 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ythdf1P59326 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ythdf1P59326 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ythdf1P59326 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ythdf1P59326 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ythdf1P59326 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ythdf1P59326 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ythdf1P59326 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ythdf1P59326 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ythdf1P59326 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ythdf1P59326 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ythdf1P59326 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ythdf1P59326 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ythdf1P59326 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ythdf1P59326 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ythdf1P59326 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ythdf1P59326 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ythdf1P59326 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ythdf1P59326 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ythdf1P59326 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ythdf1P59326 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ythdf1P59326 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ythdf1P59326 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ythdf1P59326 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ythdf1P59326 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ythdf1P59326 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ythdf1P59326 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ythdf1P59326 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ythdf1P59326 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ythdf1P59326 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ythdf1P59326 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ythdf1P59326 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ythdf1P59326 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ythdf1P59326 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ythdf1P59326 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ythdf1P59326 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ythdf1P59326 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ythdf1P59326 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ythdf1P59326 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ythdf1P59326 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ythdf1P59326 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ythdf1P59326 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ythdf1P59326 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ythdf1P59326 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ythdf1P59326 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ythdf1P59326 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ythdf1P59326 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ythdf1P59326 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms