Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Paxbp1P58501 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Paxbp1P58501 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Paxbp1P58501 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Paxbp1P58501 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Paxbp1P58501 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Paxbp1P58501 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Paxbp1P58501 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Paxbp1P58501 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Paxbp1P58501 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Paxbp1P58501 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Paxbp1P58501 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Paxbp1P58501 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Paxbp1P58501 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Paxbp1P58501 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Paxbp1P58501 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Paxbp1P58501 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Paxbp1P58501 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Paxbp1P58501 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Paxbp1P58501 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Paxbp1P58501 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Paxbp1P58501 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Paxbp1P58501 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Paxbp1P58501 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Paxbp1P58501 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Paxbp1P58501 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Paxbp1P58501 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Paxbp1P58501 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Paxbp1P58501 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Paxbp1P58501 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Paxbp1P58501 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Paxbp1P58501 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Paxbp1P58501 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Paxbp1P58501 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Paxbp1P58501 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Paxbp1P58501 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Paxbp1P58501 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Paxbp1P58501 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Paxbp1P58501 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Paxbp1P58501 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Paxbp1P58501 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Paxbp1P58501 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Paxbp1P58501 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Paxbp1P58501 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Paxbp1P58501 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Paxbp1P58501 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Paxbp1P58501 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Paxbp1P58501 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Paxbp1P58501 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Paxbp1P58501 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Paxbp1P58501 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Paxbp1P58501 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Paxbp1P58501 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Paxbp1P58501 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Paxbp1P58501 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Paxbp1P58501 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Paxbp1P58501 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Paxbp1P58501 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Paxbp1P58501 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Paxbp1P58501 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Paxbp1P58501 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Paxbp1P58501 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Paxbp1P58501 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Paxbp1P58501 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Paxbp1P58501 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Paxbp1P58501 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Paxbp1P58501 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Paxbp1P58501 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Paxbp1P58501 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Paxbp1P58501 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Paxbp1P58501 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Paxbp1P58501 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Paxbp1P58501 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Paxbp1P58501 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms