Protein–RNA interactions for Protein: P57791

Rce1, CAAX prenyl protease 2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rce1P57791 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rce1P57791 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rce1P57791 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rce1P57791 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rce1P57791 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rce1P57791 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rce1P57791 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rce1P57791 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rce1P57791 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rce1P57791 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms