Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CtnsP57757 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CtnsP57757 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtnsP57757 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtnsP57757 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtnsP57757 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtnsP57757 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CtnsP57757 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtnsP57757 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms