Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NcstnP57716 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NcstnP57716 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NcstnP57716 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NcstnP57716 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NcstnP57716 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NcstnP57716 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NcstnP57716 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NcstnP57716 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NcstnP57716 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NcstnP57716 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NcstnP57716 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms