Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Irf5P56477 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Irf5P56477 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Irf5P56477 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Irf5P56477 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Irf5P56477 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Irf5P56477 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Irf5P56477 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Irf5P56477 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Irf5P56477 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Irf5P56477 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Irf5P56477 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Irf5P56477 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Irf5P56477 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Irf5P56477 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Irf5P56477 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Irf5P56477 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Irf5P56477 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Irf5P56477 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Irf5P56477 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Irf5P56477 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Irf5P56477 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Irf5P56477 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Irf5P56477 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Irf5P56477 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Irf5P56477 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Irf5P56477 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Irf5P56477 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Irf5P56477 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Irf5P56477 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Irf5P56477 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Irf5P56477 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Irf5P56477 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Irf5P56477 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Irf5P56477 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irf5P56477 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Irf5P56477 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irf5P56477 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irf5P56477 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irf5P56477 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irf5P56477 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irf5P56477 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irf5P56477 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irf5P56477 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irf5P56477 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Irf5P56477 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irf5P56477 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irf5P56477 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irf5P56477 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irf5P56477 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irf5P56477 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irf5P56477 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irf5P56477 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irf5P56477 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irf5P56477 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irf5P56477 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irf5P56477 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irf5P56477 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irf5P56477 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irf5P56477 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irf5P56477 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Irf5P56477 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Irf5P56477 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Irf5P56477 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Irf5P56477 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Irf5P56477 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Irf5P56477 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Irf5P56477 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Irf5P56477 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Irf5P56477 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Irf5P56477 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Irf5P56477 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Irf5P56477 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms