Protein–RNA interactions for Protein: P56389

Cda, Cytidine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdaP56389 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CdaP56389 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CdaP56389 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CdaP56389 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CdaP56389 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CdaP56389 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CdaP56389 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CdaP56389 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CdaP56389 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CdaP56389 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CdaP56389 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CdaP56389 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CdaP56389 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CdaP56389 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CdaP56389 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CdaP56389 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CdaP56389 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CdaP56389 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CdaP56389 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CdaP56389 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CdaP56389 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CdaP56389 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CdaP56389 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CdaP56389 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CdaP56389 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CdaP56389 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CdaP56389 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CdaP56389 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CdaP56389 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CdaP56389 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CdaP56389 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CdaP56389 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CdaP56389 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CdaP56389 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CdaP56389 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CdaP56389 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CdaP56389 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CdaP56389 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CdaP56389 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CdaP56389 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CdaP56389 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CdaP56389 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CdaP56389 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CdaP56389 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CdaP56389 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CdaP56389 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CdaP56389 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CdaP56389 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CdaP56389 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CdaP56389 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CdaP56389 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CdaP56389 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CdaP56389 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CdaP56389 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CdaP56389 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CdaP56389 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CdaP56389 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CdaP56389 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CdaP56389 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CdaP56389 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CdaP56389 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CdaP56389 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CdaP56389 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CdaP56389 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CdaP56389 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CdaP56389 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CdaP56389 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CdaP56389 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CdaP56389 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CdaP56389 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CdaP56389 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CdaP56389 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CdaP56389 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CdaP56389 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CdaP56389 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CdaP56389 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CdaP56389 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CdaP56389 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CdaP56389 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CdaP56389 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CdaP56389 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CdaP56389 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CdaP56389 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CdaP56389 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CdaP56389 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CdaP56389 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CdaP56389 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CdaP56389 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CdaP56389 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CdaP56389 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CdaP56389 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CdaP56389 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CdaP56389 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CdaP56389 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CdaP56389 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CdaP56389 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CdaP56389 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CdaP56389 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CdaP56389 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CdaP56389 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms