Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CtskP55097 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CtskP55097 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CtskP55097 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CtskP55097 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CtskP55097 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CtskP55097 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CtskP55097 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CtskP55097 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CtskP55097 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CtskP55097 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CtskP55097 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtskP55097 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CtskP55097 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtskP55097 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtskP55097 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtskP55097 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtskP55097 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtskP55097 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtskP55097 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtskP55097 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtskP55097 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtskP55097 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtskP55097 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtskP55097 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtskP55097 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtskP55097 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtskP55097 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CtskP55097 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtskP55097 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtskP55097 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtskP55097 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CtskP55097 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CtskP55097 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtskP55097 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtskP55097 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtskP55097 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtskP55097 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtskP55097 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtskP55097 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtskP55097 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtskP55097 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtskP55097 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CtskP55097 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtskP55097 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtskP55097 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtskP55097 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtskP55097 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtskP55097 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtskP55097 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtskP55097 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtskP55097 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtskP55097 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtskP55097 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtskP55097 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtskP55097 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CtskP55097 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CtskP55097 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CtskP55097 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CtskP55097 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CtskP55097 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CtskP55097 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CtskP55097 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CtskP55097 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CtskP55097 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CtskP55097 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CtskP55097 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CtskP55097 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CtskP55097 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CtskP55097 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CtskP55097 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CtskP55097 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CtskP55097 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CtskP55097 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtskP55097 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtskP55097 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtskP55097 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtskP55097 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtskP55097 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtskP55097 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtskP55097 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CtskP55097 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtskP55097 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CtskP55097 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CtskP55097 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CtskP55097 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtskP55097 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtskP55097 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtskP55097 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtskP55097 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtskP55097 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtskP55097 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtskP55097 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtskP55097 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtskP55097 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtskP55097 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtskP55097 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CtskP55097 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CtskP55097 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CtskP55097 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms