Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NcanP55066 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NcanP55066 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NcanP55066 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NcanP55066 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NcanP55066 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NcanP55066 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NcanP55066 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NcanP55066 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NcanP55066 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NcanP55066 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NcanP55066 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NcanP55066 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NcanP55066 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NcanP55066 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NcanP55066 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NcanP55066 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NcanP55066 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NcanP55066 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NcanP55066 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NcanP55066 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NcanP55066 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NcanP55066 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NcanP55066 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NcanP55066 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NcanP55066 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NcanP55066 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NcanP55066 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NcanP55066 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NcanP55066 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NcanP55066 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NcanP55066 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NcanP55066 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NcanP55066 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NcanP55066 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NcanP55066 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NcanP55066 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NcanP55066 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NcanP55066 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NcanP55066 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NcanP55066 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NcanP55066 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NcanP55066 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NcanP55066 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NcanP55066 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NcanP55066 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NcanP55066 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NcanP55066 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NcanP55066 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NcanP55066 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NcanP55066 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NcanP55066 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NcanP55066 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NcanP55066 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NcanP55066 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NcanP55066 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NcanP55066 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NcanP55066 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NcanP55066 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NcanP55066 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NcanP55066 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NcanP55066 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NcanP55066 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NcanP55066 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NcanP55066 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NcanP55066 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NcanP55066 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NcanP55066 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NcanP55066 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NcanP55066 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NcanP55066 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NcanP55066 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NcanP55066 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NcanP55066 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NcanP55066 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NcanP55066 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NcanP55066 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NcanP55066 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NcanP55066 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NcanP55066 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NcanP55066 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NcanP55066 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NcanP55066 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NcanP55066 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NcanP55066 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NcanP55066 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NcanP55066 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NcanP55066 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NcanP55066 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NcanP55066 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NcanP55066 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NcanP55066 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NcanP55066 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NcanP55066 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NcanP55066 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NcanP55066 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NcanP55066 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NcanP55066 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NcanP55066 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NcanP55066 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms