Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GemP55041 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GemP55041 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GemP55041 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GemP55041 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GemP55041 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GemP55041 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GemP55041 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GemP55041 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GemP55041 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GemP55041 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GemP55041 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GemP55041 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GemP55041 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GemP55041 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GemP55041 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GemP55041 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GemP55041 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GemP55041 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GemP55041 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GemP55041 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GemP55041 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GemP55041 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GemP55041 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GemP55041 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GemP55041 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GemP55041 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GemP55041 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GemP55041 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GemP55041 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GemP55041 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GemP55041 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GemP55041 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GemP55041 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GemP55041 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GemP55041 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GemP55041 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GemP55041 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GemP55041 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GemP55041 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GemP55041 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GemP55041 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GemP55041 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GemP55041 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GemP55041 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GemP55041 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GemP55041 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GemP55041 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GemP55041 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GemP55041 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GemP55041 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GemP55041 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GemP55041 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GemP55041 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GemP55041 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GemP55041 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GemP55041 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GemP55041 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GemP55041 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GemP55041 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GemP55041 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GemP55041 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GemP55041 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GemP55041 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GemP55041 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GemP55041 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GemP55041 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GemP55041 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GemP55041 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GemP55041 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GemP55041 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GemP55041 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GemP55041 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GemP55041 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GemP55041 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GemP55041 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GemP55041 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GemP55041 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GemP55041 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GemP55041 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GemP55041 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GemP55041 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GemP55041 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GemP55041 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GemP55041 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GemP55041 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GemP55041 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
GemP55041 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
GemP55041 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
GemP55041 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GemP55041 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GemP55041 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GemP55041 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GemP55041 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GemP55041 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GemP55041 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GemP55041 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GemP55041 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GemP55041 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GemP55041 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms