Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fdft1P53798 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms