Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efnb1P52795 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Efnb1P52795 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms